自動車税の払い方とお得な払い方【2026年版】スマホ決済・クレジットカードの手数料と車検の注意点

自動車税（種別割）の払い方と、少しでもお得に払うための考え方を、総務省・地方税共同機構・東京都主税局の公式情報で確認し直しました。2026年9月30日時点で押さえたいのは次の点です。

自動車税は4月1日時点の持ち主に毎年かかる。2026年度の東京都の納期限は6月1日（月）だった（5月31日が日曜日のため）
払い方は、スマホ決済アプリ、クレジットカード、ペイジー、コンビニ、金融機関の窓口など。納付書のQRコード（eL-QR）でスマホ決済もできる
クレジットカードはシステム利用料がかかる（東京都の案内では1万円まで37円、以降1万円ごとに75円、いずれも税別）。カードのポイントと比べて考える
車検が近い人は、納税の確認に時間がかかる払い方に注意

自動車税（種別割）の税額

2019年10月1日以降に新しく登録された自家用の乗用車の税額です（年額）。

総排気量	税額
1,000cc以下	2万5,000円
1,000cc超1,500cc以下	3万500円
1,500cc超2,000cc以下	3万6,000円
2,000cc超2,500cc以下	4万3,500円
2,500cc超3,000cc以下	5万円
3,000cc超3,500cc以下	5万7,000円

2019年9月30日以前に登録された車は、これより高い税率です。また、新車の登録から一定期間を過ぎた車（ガソリン車などは13年、ディーゼル車は11年）は、税額が重くなります（グリーン化特例の重課）。出典は総務省 2019年10月1日、自動車の税が大きく変わりますと総務省自動車税・軽自動車税です。

払い方の比較（東京都の例）

払い方	領収書	納税の確認ができるまで	注意点
スマホ決済アプリ（バーコード）	なし	1週間程度	30万円までの納付書のみ
スマホ決済アプリ（QRコード、eL-QR）	なし	1か月程度	QRコード付きの納付書のみ
クレジットカード（eLお支払サイト）	なし	1か月程度	システム利用料がかかる
ペイジー（ネットバンキング・ATM）	なし	1週間程度	事前に金融機関への申込みが必要
コンビニ	あり	1週間程度	30万円までの納付書のみ
金融機関・都税事務所の窓口	あり	10日程度	平日の営業時間内

出典は東京都主税局都税の納付方法です。使えるスマホ決済アプリや払い方は都道府県によって違うため、届いた納付書と都道府県のサイトで確認してください。

お得に払うための考え方

クレジットカードはシステム利用料とポイントを比べる

東京都の案内では、クレジットカードで払うときのシステム利用料は、1万円まで37円、以降1万円ごとに75円（いずれも税別）です。たとえば税額3万500円なら、37円＋75円×3＝262円（税別）です。カードのポイントがこれより多くつけばお得、少なければ損になります。税金の支払いはポイントの対象外だったり、還元率が低かったりするカードもあるので、カード会社の条件を確認してください。出典は東京都主税局クレジットカード納付についてです。

スマホ決済は手数料がかからず、残高払いが基本

スマホ決済アプリは、アプリの残高から払う形が基本です。ポイントがつくかどうかはアプリや残高のチャージ方法によって違うため、各アプリの案内を確認してください。納付書のeL-QRを読み取って払う方法は、地方税共同機構の「eL-QR付き納付書でお支払い」で案内されています。出典は地方税共同機構 eL-QR付き納付書でお支払いです。

納期限を過ぎると延滞金がかかる

納期限を過ぎると、法律にもとづく延滞金がかかることがあります。お得さより、期限内に払うことを優先してください。

車検が近い人の注意点

車検のときの自動車税の納税確認は、運輸支局などで電子的に行えるため、納税証明の提示は原則として省略できます。ただし、払ってから確認できるまでに時間がかかるため、納付後10日程度のうちに車検を受ける場合は、窓口やコンビニで払い、納付書の右端の納税証明（継続検査用）を持っていくよう東京都は案内しています。スマホ決済やクレジットカードで払ってから約1週間以内に納税証明を取るときは、eLお支払サイトの履歴画面などの提示が必要です。